在纳卡冲突的停火协议达成之后，亚美尼亚国内传出消息称，阿塞拜疆除了要求割让大片领土外，还要求对近30年的“非法占领损失”进行赔偿，根据之前阿塞拜疆方面的统计，这一赔偿款项高达500多亿美元，亚美尼亚国内的反对派呼吁，签署不平等条约的帕希尼扬当局必须立即下台，避免亚美尼亚人子子孙孙都要偿还这笔巨资，然而帕希尼扬却拒绝下台，反而还将战败的责任归咎于俄罗斯“见死不救”，以及之前近30年亚美尼亚人的“松懈”上，认为这才是导致亚美尼亚战败的真正原因，自己不应当为战败负责。
就在亚美尼亚国内混乱不堪之际，据阿塞拜疆新闻网11月18日报道，阿总统阿利耶夫正式要求亚美尼亚对纳卡境内“基础设施遭到破坏”进行赔偿。他指出，亚美尼亚军队在撤退的时候，摧毁了所有的基础设施，包括房屋、水电厂，甚至连树木都伐光带走，阿塞拜疆将在国际法庭上提供诉讼，要求亚美尼亚对此照单赔偿。巴库方面已经要求国际机构和相关专家统计损失的具体情况，并将向阿塞拜疆就过去30年的所作所为进行索赔。
然而对于阿塞拜疆的索赔，亚美尼亚的态度却十分强硬，就是“要钱没有”！实际上，亚美尼亚总人口也不过300多万人，全国的GDP也只有124亿美元，如果阿塞拜疆真索要500多亿美元的赔偿，那么就算卖了亚美尼亚也还不上，因此虽然阿塞拜疆提出索赔的要求，但是亚美尼亚肯定不会同意，该国的强硬派已经对停火协议十分不满，甚至策划兵变推翻帕希尼扬，扬言要继续和阿塞拜疆开战，拒绝承认战场上的“暂时失利”，对此阿塞拜疆方面则警告称，如果拒绝赔偿的话，那么冲突不排除再次爆发。
据介绍，11月10日，由于战场上的形势已经一边倒，在亚美尼亚军方的直接建议下，帕希尼扬终于同意了停火协议，在俄罗斯的主导之下，两国同意就此停战，但是协议却对亚美尼亚十分不利，该国失去了纳卡大部分领土，还要撤走大批亚美尼亚居民，此外阿塞拜疆还保留了索赔的权利。军事专家认为，实际上这就是一份21世纪的不平等条约，再次让外界认清了“落后就要挨打”的残酷现实。